January 6th, 2021

profile

IFR

В комментариях к прошлой записи началось какое-то безумие, поэтому я решил их закрыть. Но польза от них была: в дискуссии с trueview я несколько изменил свое мнение об IFR ковида. Возьмем два больших серологических исследования в топовых журналах с большой случайной выборкой -- одно в НЙ, одно в Испании.

Exhibit 1: https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)31483-5/fulltext. На 11 мая антитела были у 5.0% процентов населения Испании. Это 2.35 млн человек. Подтвержденных смертей на тот момент было 27 тысяч (см.). Это дало бы IFR=1.15% (в самой статье этого числа нет, но мета-анализы вроде этого https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1201971220321809 для этой работы как раз и получают 1.15%). Но избыточных смертей в Испании в 1.5 больше, чем подтвержденных ковидных (см.). То есть избыточных смертей было примерно 40 тыс., и поскольку ясно, что они почти все ковидные, то получается IFR=1.7%.

Update (Feb 5): Там делали два серологических теста, у обоих специфичность ~100%, поэтому можно брать объединение их результатов. Получается 6.3% сероположительных, это 3.0 млн. Но избыточных смертей весной на самом деле было 48 тыс. (я посчитал). Итого IFR=1.6%.

Exhibit 2: https://www.nature.com/articles/s41586-020-2912-6. К концу мая в НЙ было 20% населения с антителами. Остюда авторы статьи получают IFR=0.97%, исходя из кол-ва смертей от *подтвержденного* ковида (в частности, они исключают смерти от *предположительного* ковида!). На тот момент избыточная смертность в НЙ была в 1.5 раза выше, чем кол-во подтвержденных смертей (см.), т.е. реально можно предположить IFR=1.5%.

Понятно, что IFR сильно зависит от возраста (см. https://github.com/mbevand/covid19-age-stratified-ifr и ссылки там), поэтому интегральный IFR в каждой стране или городе зависит от местной возрастной пирамиды (скажем, в Латинской Америке интегральный IFR может быть раза в два ниже западноевропейского). Но для возрастной пирамиды похожей на Испанию/Нью-Йорк, я думаю, можно брать IFR=1.5% как разумную интегральную оценку.

Есть странные люди, которые по-прежнему повторяют про небольшое отличие от гриппа. Это смехотворно. По оценкам CDC, кол-во смертей от гриппа в США за сезон обычно находится в диапазоне 20--50 тыс. (https://www.cdc.gov/flu/about/burden/), а кол-во симптоматических инфекций за сезон -- 20--40 млн. С учетом того, что симптоматических инфекций, по оценкам, примерно треть от всех, это в среднем соответствует где-то IFR=0.05% для гриппа (https://github.com/mbevand/covid19-age-stratified-ifr). Здесь кол-во смертей -- это НЕ просто кол-во смертей с гриппом в death certificate, а довольно сложная оценка, полученная с учетом того, что многие смерти от гриппа могут быть записаны как смерти от пневмонии и т.д. (https://www.cdc.gov/flu/about/burden/how-cdc-estimates.htm). IFR=0.05% -- т.е. получается где-то (очень приблизительно) в 30 раз меньше, чем у ковида (отношение по возрастным группам см. тут: https://github.com/mbevand/covid19-age-stratified-ifr). Избыточная смертность в США на сегодня где-то тысяч 450 (см.), так что уже на порядок больше обычного кол-ва смертей от гриппа за сезон, а эпидемия ковида там еще в самом разгаре.

Как и обещал, за голословные утверждения о том, что ковид не опаснее или лишь немного опаснее гриппа, я теперь буду сходу банить (не голословные -- т.е. когда они сопровождены подробным обоснованием и объяснением, почему всё написанное выше неверно, -- допускаются).